# MAEN 計算結果 — 2026-10-05

[結果サイトを見る](https://yuu-honda.github.io/maen-results/)

**1つの分割では少し改善、別の分割では悪化しました。安定した改善は確認できません。** 既知薬剤の細胞株応答を予測する、小さなCPU計算の記録です。新薬の発見や治療効果を示すものではありません。

![未見細胞株でのMAE比較](mae-comparison.png)

縦軸はpGI50の平均絶対誤差（MAE）、小さい方がよい値です。灰色は学習データの薬剤平均、緑はそれに組織分類による補正を加えたモデルです。棒の線は細胞株を単位に200回再標本化した記述的95%区間です。誤差区間は広く、改善の優位性を示しません。

|分割seed|薬剤平均MAE|モデルMAE|差（モデル−基準）|基準RMSE / モデルRMSE|
|---|---:|---:|---:|---|
|20261004（再現確認）|0.654|0.638|−0.016|0.829 / 0.825|
|20261005（分割感度）|0.652|0.715|+0.063|0.866 / 0.906|

2つ目は別の固定分割での感度確認で、独立した新データの検証ではありません。両方を開示し、良い結果だけ選びません。今回は候補数や学習量を増やしておらず、同じモデルの分割依存性を調べました。

## 不確実性は十分だったか

![予測区間の被覆率](interval-coverage.png)

80%を目標に校正しましたが、未見細胞株で全6薬剤を同時に覆う率は55.6% / 44.4%でした。目標未達です。行単位では83.3% / 81.5%でしたが、細胞株全体への信頼性とは区別します。これは測定誤差や臨床安全性の区間ではありません。

## 何を計算したか

- NCI/DTP公式GI50集約値。既知抗がん剤6種×55細胞株＝330行。
- 学習37株/222行、校正9株/54行、未見評価9株/54行。細胞株全体で分離し、行ランダム分割は使いません。
- pGI50 = −log10(GI50 [M])。応答誤差の単位であり、治療の成功率ではありません。
- 薬剤ごとに最大実験数の集約条件を採用し、6薬剤共通株を使用。3株未満の前立腺群2株は除外。
- モデルと固定係数は変更せず、seedだけ比較。testによるモデル選択やハイパーパラメータ探索はしません。
- 保存済み約1.16MBの公式データを再利用し、追加ダウンロードなし。CPU1スレッド・低優先度、各計算1秒未満。実測経過秒は[集計JSON](summary.json)に保存。

## 出典と再現

[NCI/DCTD Data](https://dctd.cancer.gov/data-tools-biospecimens/data) の [Compound Inhibition Bulk Data Download](https://dtp.cancer.gov/dtpstandard/subsets/comp.jsp) を公式取得スクリプトで使用。[NCI再利用方針](https://www.cancer.gov/policies/copyright-reuse)は一般テキストについての方針で、データ固有の再配布権を確認したとは扱いません。生XML・細胞株別応答・予測表は公開対象に含めず、集計結果・方法・出典URL・checksumだけを載せています。

MAEN作業コピーで実験コードcommit `cd1040556093c032e768548510d3daecba3e2bd3` を使い、同じchecksumのキャッシュを保持して次を実行します。公開集計JSONには元コードSHA256と実測秒も含みます。

```bash
nice -n 15 python3 maen.py run --seed 20261004 --out runs/check
nice -n 15 python3 maen.py run --seed 20261005 --out runs/sensitivity
```

取得が必要な場合はREADMEの `experiment` コマンドを使用します。上限は6薬剤/12MB、計算60秒、1スレッド。コード本体は非公開です。公開閲覧者に完全な実行環境が提供されているとは主張しません。

## 限界と更新履歴

未知化合物・原実験/プレート単位の分離・他施設での評価・打ち切り補正・生体内/臨床効果は未検証。集約条件や最高濃度が薬剤によって異なり、少数細胞株での結果です。区間の厳密な被覆保証も主張しません。

2026-10-04: 初版の小規模ベンチマーク。2026-10-05: 同じ分割の再現と追加1分割の感度確認、比較グラフを追加。このリポジトリには集計結果と静的サイトだけを保存しています。実験コード本体は非公開です。